เครื่องสแกนลายนิ้วมือสามารถแบ่งได้เป็น 4 ประเภท ได้แก่[7] เครื่องสแกนแบบแสง (optical scanners), เครื่องสแกนแบบความจุไฟฟ้า (capacitance scanners), เครื่องสแกนแบบคลื่นเสียงความถี่สูง (ultrasonic scanners) และเครื่องสแกนแบบความร้อน (thermal scanners) การทำงานขั้นพื้นฐานของเครื่องสแกนทุก ๆ ประเภท คือเพื่อให้ได้ภาพลายนิ้วมือของบุคคลและค้นหาการจับคู่ที่ตรงกันในฐานข้อมูล ซึ่งการวัดประสิทธิภาพของภาพลายนิ้วมือนั้นจะใช้หน่วยจุดต่อนิ้ว (DPI)[8]
- เครื่องสแกนแบบแสง ถ่ายภาพลายนิ้วมือโดยใช้กล้องดิจิทัล
- เครื่องสแกนแบบความจุไฟฟ้า หรือ เครื่องสแกนซีมอส (CMOS scanners) ใช้ตัวเก็บประจุและต่อด้วยกระแสไฟฟ้าเพื่อสร้างภาพลายนิ้วมือ โดยเครื่องสแกนประเภทนี้มีแนวโน้มที่ดีเยี่ยมในแง่ของความแม่นยำ
- เครื่องสแกนลายนิ้วมือแบบคลื่นเสียงความถี่สูง ใช้คลื่นเสียงความถี่สูงในการทะลุชั้นหนังกำพร้า (ภายนอก) ของผิวหนัง
- เครื่องสแกนแบบความร้อน ใช้การสัมผัสถึงความแตกต่างของอุณหภูมิบริเวณผิวสัมผัส ระหว่างลายเส้นนูนกับแนวร่องของลายนิ้วมือ
อย่างไรก็ตาม เครื่องสแกนลายนิ้วมือทั้งหมดมีข้อด้อยต่อการหลอกลวงทางเทคนิคที่เกี่ยวข้องกับการถ่ายภาพลายนิ้วมือ การประมวลผลภาพถ่ายโดยใช้ซอฟต์แวร์พิเศษ และการพิมพ์แบบจําลองลายนิ้วมือโดยใช้เครื่องพิมพ์ 3 มิติ[